Profesor, misionar, plantator de biserici.
J. Allen Thompson s-a căsătorit cu Marilyn, mâna sa dreaptă în lucrare, în septembrie 1954, iar el a graduat din CIU (Columbia International University) în 1955.
1957-1960 Allen a servit ca director la seminarul Los Pinos Nuevos din Cuba.
În1967, Allen a devenit director la misiunea West Indies, iar aceștia s-au extins până în Brazilia, Spania, Franța, Italia.
Din 2000, Allen a lucrat pentru Biserica prezbiteriană Redeemer și cu pastorul Tim Keller în New York.
El și soția sa au două fiice, Shari și Debi, și 8 nepoți.